Plusieurs hypothèses peuvent être avancées pour explquer les événements pour le moins troublants qui se produisent sur l'île. Est-ce que les disparus ont vraiment échoué là par hasard ? Sont victimes d'une expérience ? D'un test ?
* Jurassic Park :
Le début de Lost, les disparus, ressemble à une histoire on ne peut plus réaliste et classique. Par rapport à ce canevas de départ, le premier élément perturbateur se présente sous la forme d'une créature visiblement gigantesque qui vit dans la jungle, puis qui dévore ensuite le pilote de l'avion avant de laisser son cadavre au sommet d'un arbre...
Ces créatures ont plusieurs caractéristiques marquantes :
1. Elles sont immenses et vivent dans la jungle
2. Elles sont voraces et chassent les être humains
3. Elles sont furtives et difficiles à percevoir
Compte tenu de tous ces éléments, il est difficile de ne pas penser à des dinosaures. Ceux-ci, en effet, remplissent ces différents critères, sans parler du fait que les cris qu'ils poussent ressemblent beaucoup à ceux que l'on entend dans Lost à chaque fois que les personnages se trouvent confrontés à eux.
Evidemment, lorsqu'Hurley évoque cette hypothèse devant Jack, ce dernier répond que c'est impossible car les dinosaures ont disparu... Mais rien n'empêche d'imaginer que les rescapés du crash ont échoué dans une sorte de Jurassic Park géant monté par une compagnie se livrant à des expériences sur la génétique.
Dans le même ordre d'idée, on peut aussi imaginer que les divers monstres qu'ils croisent sont le produit d'expériences scientifiques interdites menées par un savant fou ou par l'armée, auquel cas il seraient plutôt dans une sorte « d'île du Docteur Moreau », où tous les malheureux rescapés qui ont le malheur d'échouer finissent par être tués par la faune locale...
* La religion :
L'hypothèse religieuse repose principalement sur la présence de Locke et sur le rôle très particulier qu'il va jouer parmi des disparus.
Dans le second épisode, il montre à Walt un jeu de Backgammon, en lui expliquant que les blancs représentent la Lumière, et les noirs, les ténèbres. Or, plus l'histoire de Lost va évoluer, et plus ce qui se déroule sur l'île va effectivement ressembler à un affrontement entre la lumière et les ténèbres.
Se pourrait-il que tout ce que vivent les personnages soit une sorte de test destiné à éprouver leur foi ?
* L'après-vie :
A plusieurs reprises, Jack et les autres disparus s'étonnent d'avoir survécu avec seulement quelques blessures légères à un accident qui aurait logiquement du tous les tuer (l'avion s'étant brisé en trois parties, on peut imaginer la violence de l'impact)
Mais si les survivants n'avaient pas survécu ? Si tout le monde avait été tué ? Dans ce cas, tout le groupe serait dans une sorte d'après-vie, un purgatoire dans lequel se retrouveraient tous ceux qui avaient besoin de se libérer de leur passé et de faire la paix avec eux-mêmes...